(二) 靈育及價值觀培養
學校的建立與發展一直都得到天父的看顧與保守。聖經說：『教養孩童，使他走當行的道，就是到老他也不偏離』(箴言22章6節)。為了讓學生接受更佳的聖經教育，培養良好的品德及建立正確的價值觀，學校自創校以來，皆曾邀請不同的教會到校協助推展福音工作，協助撒母耳團契的週會或小組活動，不少的學生都因此而在聖經課以外加深了對信仰的認識，並接受基督作為他們個人的救主。

2007年9月開始，學校更開放校園給兩間教會：柴灣福音堂及宣道會愛光堂，兩所教會的傳道長駐學校，為學校主持講道的週會及不同的宗教活動，更每天與團契老師們一起為不同級別的慕道學生開設小組，並在撒母耳團契以外建立了 U-link青年團契及基督少年軍，令學校的信仰教育及福音工作進入了一個新紀元。